Watamu sorge sulla costa keniota a circa 110 km a nord-est da Mombasa e 15 km a sud di Malindi.
Si estende sul tratto di costa che va dal Mida Creek al villaggio di Mayungu, e, verso l'entroterra fino al villaggio di Gede. Il comprensorio della costa di Watamu è formato dalla spiaggia Turtle
Bay, dalla baia denominata Blue Lagoon, dalla baia denominata Watamu
Beach, dalla spiaggia di Ocean Breeze, dal tratto di scogliera di
Kaanani e dalla spiaggia di Jacaranda. Il comprensorio di Watamu è parte integrante della Riserva Marina di Malindi e Watamu
e, più in particolare, la spiaggia Garoda-Turtle Bay è protetta come
Parco Marino in quanto, lungo questo tratto di spiaggia, non è difficile
imbattersi in nidi di tartarughe marine nel mese di marzo.
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